Contexte
L'empire d'Emeraude a connu une période trouble durant plusieurs années. Alors qu'une prophécie annonçait que le dernier empereur de la famille Hanteï apporterait la chute de l'Empire tout entier aux mains de Fu Leng, le clan du scorpion a alors pris la plus grave décision de son histoire. Pour servir l'Empire, l'empereur aimé de tous devait disparaître afin que la prophétie ne puisse se réaliser.
Le clan du scorpion provoqua alors un coup d'Etat qui mena à la mort de l'empereur Hanteï 38, cependant, le coup d'Etat ne fut pas un succès pour le scorpion. Tous les clans s'unirent contre eux et face à la puissance combinée de tous les clans, le scorpion ne put faire autrement que d'accepter la défaite. Devant la mort de l'empereur, le champion du clan du lion Toturi Akodo se proclama empereur pour ramener l'Empire vers une ère de paix et punir ceux qui avaient tuer son maître.
Cependant, le fils de l'Empereur, Hanteï 39 était toujours vivant. Face à la prise de position du scorpion et du champion du clan du lion, la parole de l'empereur fit voix : le scorpion était dissous, quand au clan du lion, la famille akodo toute entière fut rayée des chroniques du clan et tous ses samuraï devinrent des Ronin.
Ce que tout le monde ignorait cependant, c'est qu'Hanteï 39 allait réaliser la prophétie tant redoutée par le scorpion. Fu Leng prit en effet possession de son corps et prit la tête de l'Empire, réalisant ainsi son projet démoniaque de réclamer Rokugan pour lui seul. Les clans de rokugan s'allièrent une fois de plus, recevant l'aide des mystérieux Naga pour vaincre la souillure de l'Outremonde. Face à cette tragédie, le dernier Kami encore vivant, Togashi le dragon, réunit un nouveau groupe de Tonnerre représentant chaque clan pour battre son frère maléfique. S'il trouva la mort dans la bataille, les 7 samuraï purent vaincre l'immonde Kami de Jigoku, affirmant une fois de plus la force des hommes face à la corruption.
A la fin de la bataille, le ronin Toturi le Noir, ancien champion et tonnerre du clan du lion devint le nouvel empereur, créant ainsi la dynastie Toturi dont il serait le premier représentant : Toturi Ier, rétablissant par la même les Akodo dans le clan du Lion
(parce oui, ils ne sont plus des ronins mais comme le meujeu il fait ce qu'il veut, tous ceux qui le contredisent verront leur clan entier se faire seppuku parce que je suis l'incarnation de Fu Leng et que je fais ce que bon me semble !) Les hommes se sont unis une fois de plus pour affronter le mal, mais celui-ci continue de grandir malgré tout. Les forces de l'Outremonde sont unis derrière leur dieu, ainsi que son champion Daigotsu cependant, elles ne sont pas les seules à observer le monde des hommes... D'autres forces en présence voient dans la situation actuelle, le moment idéal pour agir et changer la face du monde une bonne fois pour toute.
Depuis deux années, l'empereur Toturi Ier a régner sur un Empire en paix. Suite à la grande guerre des clans provoquée par Fu Leng, l'empire se reconstruit et le peuple se met à espérer un nouvel âge d'or de prospérité et d'harmonie. A la fin de l'année 1130, l'Empire est ébranlée par la disparition Toturi Ier, ses ravisseurs semblent être une fois de plus le clan du scorpion. Suite a cette révélation, le champion d'émeraude Kakita Toshimoko et le chancelier Takuan bannissent le clan du scorpion à errer dans les terres arides tandis que les enfants du clan sont confiés au clan de la Grue.
Après la disparition de l'empereur, le chancelier Takuan voit ses pouvoirs augmenter : il encourage les clans à maintenir la paix bien qu'il soit conscient que la disparition de l'empereur ne cause tôt ou tard une nouvelle guerre inter-clanique. Cependant un autre évènement vient troubler cette période, le champion d'émeraude Kakita Toshimoko se suicide en laissant un haïku expliquant qu'il a failli à l'empereur en ne retrouvant pas sa trace. La seule lumière dans cette sombre année semble être le clan du Crabe qui réussis grâce à l'appui de ses alliés Naga à remprendre la forteresse de la famille Hiruma des mains des forces de Jigoku.
Clan du Crabe
Le clan du Crabe est fort et unis après avoir purgé ses rangs des traîtres à la solde de l'Outremonde. Avec l'aide de leurs alliés Naga, ils remportent une grande victoire face à leur ennemis. La province Hiruma est ainsi purgées par les shugenja Kuni et Naga pour permettre de rétablir la province en un lieu de résistance contre les forces de Jigoku. le processus sera long et difficile.
Clan du Dragon
Le clan du dragon subit un changement de taille dans son organisation. Après avoir été dirigé pendant des siècles par le kami Togashi sous différentes identités, le commandement du clan passe entre les mains de la tonnerre du clan : Mirumoto Hitomi. Si Hitomi a toujours été connue pour être colérique et impétueuse, elle semble accablée désormais par le poids de son office. Des rumeurs font états de tensions entre les différentes familles du clan du Dragon, en particulier les familles Togashi et Agasha...
Clan du Lion
Le clan du Lion est dans une position délicate : de nombreux traditionalistes trouvent difficile de s'adapter au nouvel empire compte tenu de leur tradition de loyauté envers la famille Hanteï malgré sa corruption par Fu Leng et reconnaissent mal l'autorité de Toturi. Leurs armées ont subis de nombreuses pertes durant la guerre et n'ont pas encore retrouvée leur force d'avant guerre. Si la famille Akodo a été réhabilité, Toturi ne peut faire montre de favoritisme pour son ancienne famille, la tête du clan revient donc encore au champion controversée Ikoma Tsanuri, malgré ses qualités et sa relation avec l'ancien champion Matsu Tsuko...
Clan de la Licorne
Le clan de la Licorne est en grande forme surtout comparé à ses rivaux. Le champion Shinjo Yokatsu est un homme expérimenté qui a conduit son clan à de nombreuses victoires. Le clan de la Licorne devient le protecteur des lois de l'Empire et le clan en profite pour établir de nombreux magistrats d'émeraude. Ils sont reconnus dans tout Rokugan pour leur grandeur martiale et leur sens de la justice. Avec la disparition de l'empereur et du champion d'émeraude, le clan de Licorne mobilise ses magistrats pour faire ne sorte que la loi de l'empereur s'applique encore.